งานห้องปฏิบัติการ เป็นงานหนึ่งในสำนักงานเลขานุการคณะเภสัชศาสตร์ มหาวิทยาลัยนเรศวร มีภารกิจหลักในการบริหารจัดการเรียนการสอนรายวิชาปฏิบัติการของคณะเภสัชศาสตร์ มหาวิทยาลัยนเรศวร ซึ่งแบ่งออกเป็น 2 หน่วยงานย่อยภายใต้งานห้องปฏิบัติการ ได้แก่

              1. หน่วยปฏิบัติการ มีบุคลากร จำนวน 7 คน มีภารกิจในการเตรียมปฏิบัติการรายวิชา การควบคุมดูแลวัสดุครุภัณฑ์วิทยาศาสตร์ การจัดการสิ่งแวดล้อม และห้องปฏิบัติการปลอดภัย ของคณะเภสัชศาสตร์ มหาวิทยาลัยนเรศวร 

              2. หน่วยประสานงานวิจัย มีบุคลากร จำนวน 1 คน มีภารกิจในการประสานการจัดทำวิจัยทั้งแหล่งทุนภายในและภายนอก ของอาจารย์ เจ้าหน้าที่ และนิสิต ของคณะเภสัชศาสตร์ มหาวิทยาลัยนเรศวร